哲学学科负责人为唐文明教授。

哲学系为哲学学科门类和哲学一级学科单位，包括哲学全部7个二级分支学科。其中，伦理学是清华哲学系的优势学科；马克思主义哲学、中国哲学和外国哲学是清华哲学系重点建设学科； 逻辑学是清华哲学系的传统特色学科。2008年，本系伦理学被评为北京市重点学科。

在“985二期”建设期间，哲学系将继续承担哲学一级学科建设的主要工作，并以此为平台，追求学科建设的内涵式发展。具体目标是：

（1）从师资配制、人才培养、教学体系和学术研究诸方面深化各二级学科建设；

（2）集中力量，优先发展马克思主义哲学、中国哲学、外国哲学三个学科；

（3）以最快的速度，将哲学系优势学科伦理学建设成为全国重点学科；

（4）再以若干年的时间，力争将清华哲学系哲学一级学科建设成为全国重点学科；

（5）通过5 - 10年的努力，建设2 - 3个国内领先、国际一流的哲学二级学科，进而把清华大学哲学系建成国内外知名的一流学科系。