哲学系教学体系包括本科生教学、硕士生教学、博生师生教学三个层次，基本特点是:

(1)以哲学一级学科为平台，三个层次贯通，按照哲学8个二级学科设置主干课程和选修课程，构成了层次完备、覆盖全面的哲学学科教学体系;

(2)坚持人文基础教育和哲学专业教育相结合、专业理论学习和科研能力培养相结合、哲学专业学术人才培养和高层次社会应用型人才培养相结合;

(3)充分利用哲学系和清华大学的资源，设置了常规性的国际交换培养和联合培养的学生培养机制。除邀请国际著名学者来系讲座、授课外，哲学系每年均择优选派多名各层次学生到国外学习，使本系学生在知识和素质两方面都能得到国际化的培养。

(4)本学科三个层次，均招收大陆境外留学生(含港、澳、台)，实现了生源的全国化和国际化。